Prefixes mentioned on the external list on the FHIR Code Systems page. This list is mostly complete. Notably, some entries that have not been curated:
0000009atcc)
clinicaltrials)
clinvar)
cosmic)
cpt)
cvx)
dbsnp)
dicom)
dsm5)
ensembl)
hc.din)
hc.npn)
hgnc)
hl7.v2codesystem)
hl7.v3codesystem)
icd10)
icd9)
icf)
ietf.language)
imgt.hla)
iso.3166)
loinc)
lrg)
ncit)
ndc)
ndfrt)
nucc.taxonomy)
omim)
pharmgkb.gene)
pubmed)
radlex)
refseq)
rxnorm)
snomedct)
so)
ucum)
unii)